Pourriture du col
Neck rot
Ce bulbe d’oignon espagnol (cv 'Red Fortress') provenant d’un entrepôt montre une sporulation blanchâtre à grisâtre sur les tuniques sèches, près du col. À travers ces tuniques, on aperçoit des zones circulaires (voir flèches) où le bulbe est mou. Ces zones déprimées sont causées par une pourriture des tuniques internes (non visible ici). Les tests de laboratoire ont révélé la présence du champignon Botrytis sp., responsable de la pourriture du col chez les Allium.
 
Le conseiller agricole mentionne que le producteur a commercialisé une partie de sa récolte à la fin septembre et que les bulbes étaient sans symptôme. Trois mois plus tard (décembre), la pourriture du col s’est développée en entrepôt et affecte plus de 75 % des bulbes d’oignon.
L’intérieur d’un bulbe d’oignon espagnol (cv 'Red Fortress') provenant d’un entrepôt montre une pourriture humide et translucide qui débute au niveau du col et qui descend par la suite vers l’ensemble des tuniques. Des sclérotes noirs sont visibles entre les tuniques (voir flèches). La démarcation entre les tissus affectés et sains est nette. Les tests de laboratoire ont révélé la présence du champignon Botrytis sp., responsable de la pourriture du col chez les Allium.
 
Le conseiller agricole mentionne que le producteur a commercialisé une partie de sa récolte à la fin septembre et que les bulbes étaient sans symptôme. Trois mois plus tard (décembre), la pourriture du col s’est développée en entrepôt et affecte plus de 75 % des bulbes d’oignon.
L’intérieur d’un bulbe d’oignon espagnol (cv 'Red Fortress') provenant d’un entrepôt est complètement recouvert d’un mycélium et de conidies grisâtres. La moisissure s’est développée à la suite d’une pourriture touchant l’ensemble des tuniques. Les tests de laboratoire ont révélé la présence du champignon Botrytis sp., responsable de la pourriture du col chez les Allium.
 
Le conseiller agricole mentionne que le producteur a commercialisé une partie de sa récolte à la fin septembre et que les bulbes étaient sans symptôme. Trois mois plus tard (décembre), la pourriture du col s’est développée en entrepôt et affecte plus de 75 % des bulbes d’oignon.
Ce bulbe d’oignon espagnol (cv 'Red Fortress') provenant d’un entrepôt montre une sporulation blanchâtre à grisâtre sur les tuniques sèches, près du col. À travers ces tuniques, on aperçoit des zones circulaires (voir flèches) où le bulbe est mou. Ces zones déprimées sont causées par une pourriture des tuniques internes (non visible ici). Les tests de laboratoire ont révélé la présence du champignon Botrytis sp., responsable de la pourriture du col chez les Allium.
 
Le conseiller agricole mentionne que le producteur a commercialisé une partie de sa récolte à la fin septembre et que les bulbes étaient sans symptôme. Trois mois plus tard (décembre), la pourriture du col s’est développée en entrepôt et affecte plus de 75 % des bulbes d’oignon.
Ces bulbes d’oignon sec (cv 'Norstar') provenant d’un entrepôt montrent un ramollissement de la partie supérieure des bulbes ainsi que la présence de mycélium et de sclérotes noirs près du col. Les tests de laboratoire ont révélé la présence du champignon Botrytis sp., responsable de la pourriture du col chez les Allium.
Une coupe longitudinale d'un bulbe d'oignon sec (cv 'Norstar') provenant d’un entrepôt montre une pourriture interne brune et humide débutant au col et progressant vers l’ensemble des tuniques. Les tuniques externes sont les plus affectées. On aperçoit également au col la présence de sclérotes noirs. Les tests de laboratoire ont révélé la présence du champignon Botrytis sp., responsable de la pourriture du col chez les Allium.
Une coupe longitudinale d'un bulbe d'oignon sec (cv 'Norstar') provenant d’un entrepôt montre une importante pourriture interne brune et humide au col et progressant vers l’ensemble des tuniques. On aperçoit également au col la présence de sclérotes noirs. Les tests de laboratoire ont révélé la présence du champignon Botrytis sp., responsable de la pourriture du col chez les Allium.
Une coupe longitudinale d'un bulbe d'oignon sec (cv 'Norstar') provenant d’un entrepôt montre une importante pourriture interne brune et humide au col et progressant vers l’ensemble des tuniques. On aperçoit également au col la présence de sclérotes noirs. Les tests de laboratoire ont révélé la présence du champignon Botrytis sp., responsable de la pourriture du col chez les Allium.
Oignon sec - Pourriture du col (Botrytis sp.)
Oignon sec - Pourriture du col (Botrytis sp.)
Oignon sec - Pourriture du col (Botrytis sp.)
Oignon sec - Pourriture du col (Botrytis sp.)
Oignon sec - Pourriture du col (Botrytis sp.)
Oignon sec - Pourriture du col (Botrytis sp.)
Oignon sec - Pourriture du col (Botrytis sp.)
Oignon sec - Pourriture du col (Botrytis sp.)
Description

La pourriture du col est une maladie commune et fréquente de l’oignon en entrepôt. Elle se manifeste parfois sur les bulbes au champ lors de saisons humides. Elle affecte la plupart des Allium, mais les oignons blancs et espagnols sont particulièrement sensibles. Les pertes de rendement peuvent êtes importantes en entrepôt (30 à 50 %). Différentes espèces de Botrytis sont capables d’induire cette pourriture dont B. aclada (syn. B. allii) et B. squamosa (sur oignon et échalote surtout) et B. porri et B. byssoidea (sur ail et poireau surtout).

Cycle de la vie

Le champignon hiverne dans le sol, les bulbes infectés et les résidus de culture sous la forme de sclérotes. Les sclérotes demeurent viables quelques années. Botrytis peut parfois se propager par la semence. Au printemps, par temps frais (entre 15 et 20 °C) et pluvieux, les sclérotes germent et produisent des conidies (inoculum primaire). Cet inoculum est dispersé par le vent et la pluie et va infecter les feuilles. Les infections se produisent, mais demeurent latentes et ne se manifesteront qu’à la sénescence des feuilles (maturation du bulbe) ou lors de l’entreposage (4 à 8 semaines plus tard). Botrytis colonise également le col des bulbes d’oignon en fin de végétation, lors de la maturation des bulbes, alors que les tissus du col deviennent moins turgescents. Botrytis peut alors envahir plus facilement ces tissus. Les bulbes infectés sont légers à cause des tissus internes mous et des tuniques externes sèches. Les bulbes infectés qui se développent en entrepôt ne peuvent pas infectés des bulbes sains, car Botrytis ne se développe que sur des tissus sénescents ou morts, jamais à partir de tissus vivants.

Symptômes et dommages

Bulbe : la pourriture débute au sommet des bulbes, près du col, et envahit ensuite les tuniques externes et internes, jusqu’au plateau racinaire. Les tuniques deviennent molles, humides et translucides. Les bulbes infectés sont plus légers. Présence d’une sporulation grisâtre et de sclérotes noirs sur et dans le bulbe. Le bulbe sèche puis se momifie.

Ne pas confondre

La pourriture du col peut être confondue à des pourritures molles bactériennes (absence de sporulation).

Méthodes de lutte

Pour contrer le développement de la pourriture du col et diminuer la banque de sclérotes dans le sol, il faut prioriser la rotation des cultures (> 2 ans) avec des plants non hôtes (maïs, carotte, betterave) et éliminer les déchets d’oignon laissés au champ, les bulbes blessés ou à col épais. Un séchage et un entreposage adéquat des bulbes (0 à 1 °C, 70 à 75 % d’humidité relative) réduisent la maladie. Au fil des ans, cette maladie a été réduite par l’enrobage des semences avec des fongicides systémiques et par le séchage à l’air chaud.

Références et liens

Richard C. & Boivin G. (1994). Pourriture du col. Dans Maladies et Ravageurs des Cultures Légumières au Canada. La Société Canadienne de Phytopathologie et la Société d'Entomologie du Canada, Canada. p. 208-209. (http://phytopath.ca/wp-content/uploads/2014/10/MRCLC/ch13-oignon.pdf)
 
Schwartz H. K. & Mohan S. K. (Eds) (2008). Neck Rot. Dans Compendium of Onion and Garlic Diseases and Pests. 2e éd. APS Press, The American Phytopathological Society, St-Paul, Minnesota. p. 47-49.

http://extension.usu.edu/files/publications/factsheet/onion-neckrot.pdf

http://learningstore.uwex.edu/assets/pdfs/A3803.pdf