La pourriture du cœur est causée par différents champignons présents naturellement dans les vergers dont le plus commun est Alternaria alternata. Cette maladie n’affecte que le pommier et particulièrement les variétés qui ont une zone stylaire (œil) ouverte comme la 'Délicieuse', 'Délicieuse jaune' et 'Idared'. Les fruits infectés ont une apparence normale lors de la récolte et ne sont détectés qu’à la suite d’un entreposage prolongé. La pourriture du cœur est fréquente et mineure et ne se propage pas.
Durant la floraison, lorsque la température est douce et humide, les champignons colonisent les pièces florales dès que les boutons floraux s’ouvrent. Lorsque les conditions environnementales empêchent la fermeture de l’œil des fruits durant leur développement, les champignons pénètrent dans les fruits par cette ouverture de l’œil, ce qui permet aux spores d’atteindre le cœur et les loges carpellaires qui offrent alors des conditions propices au développement du champignon.
Fruit : lorsque les fruits infectés sont tranchés en deux, de la pourriture et du mycélium grisâtre à noir sont observés autour des graines dans les loges carpellaires. La zone du cœur (endocarpe) prend parfois une teinte rouille à brune. Lors d’entreposage à long terme, le champignon peut envahir la chair. Les fruits infectés mûrissent et chutent prématurément.
La pourriture du cœur peut être confondue avec l’alternariose (Core rot) qui envahit le cœur et la chair contrairement à la pourriture du cœur qui est confinée au cœur.
Les mesures préventives utilisées contre la pourriture du cœur consistent à éviter de planter des cultivars dont l’œil est ouvert et à employer des cultivars qui offrent une tolérance à la pourriture du cœur puisque la sensibilité variétale est variable. Maintenir un bon état sanitaire dans les vergers en assurant une pénétration de la lumière et une circulation d’air entre les arbres, en ramassant les tissus jonchant le sol et en contrôlant les tétranyques puisqu’ils peuvent disperser les spores des champignons. Des traitements fongiques peuvent être appliqués lors de la floraison, mais les résultats sont mitigés, tandis qu’ils ne sont d’aucun recours une fois que le champignon est logé dans le cœur. Les fruits qui sont trop mûrs lors de la récolte peuvent avoir une incidence à la pourriture du cœur et ne devraient pas être entreposés, mais commercialisés rapidement.
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